基因定位的常用方法？

一、基因定位的常用方法？

基因定位方法：

1、系谱分析法

在早期的人类遗传学研究中，基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体，男子有一个X染色体和一个Y染色体，Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲，以后又必定传给女儿。

这种遗传方式称为交叉遗传。如果在一个家系中外祖父是某种疾病的患者，母亲的表型是正常的，外孙中有半数是患者，就可以判断有关的隐性致病基因是在 X染色体上。色盲基因便是1911年通过系谱分析最早发现的人的性连锁基因。位置在X染色体上的性连锁基因称为X连锁基因。

常染色体遗传也有它自己的系谱特点。根据系谱分析一般只能够判断基因属于性染色体或常染色体，可是不能判断究竟属于哪一个常染色体。

2、非整倍体测交法

非整倍体测交法可以用来测定基因属于哪一个常染色体。

用常染色体隐性突变型纯合体（a/a)和野生型二倍体（+/+）杂交，再用子一代杂合体(a/+)和隐性亲本回交,在它们的子代中表型是野生型的和表型是突变型的各占50%。

二、什么是内参基因？常用内参基因有哪些？

可以鉴定出两种状态下细胞总RNA样品内A基因量的差异，但这个差异包含着误差：

1，总RNA量的不准确性，虽然用分光光度计计算了浓度，但实际上还是有误差的存在，对那些表达水平只差那么丁点儿的样品尤其关键；

2，细胞整体表达水平会在不同情况下有差异，比如说高氧状态下细胞分裂速度更快，此时细胞内绝大多数基因表达水平都上调了，那此时A基因的增加就包括了整体水平的增加量和氧特异性诱导产生的增加量。所以，我们需要找个能够表现细胞整体表达状态的基因作为参照，用来扣除第2种误差，同时，该参照也可以减少第1种误差对实验结果的误导。

三、什么是内参基因?常用内参基因有哪些？

这个概念一般是用在定量pcr中。定量pcr是要检测某个基因的表达，降低或者提高，但是当你得出结果以后，你并不知道是它本身的表达降低/提高了，还是你操作过程中造成的误差（比如提rna时的损失），所以这个时候需要同时检测另外的基因作为参照。这个基因就是内参基因，这类基因是生物体或者细胞中稳定表达的基因，表达量几乎不变。常用的内参基因如β-actin，gapdh，18s-rrna等

四、基因表达数据库：解读基因活动的宝库

什么是基因表达数据库？

基因表达数据库是基于遗传学和生物信息学的研究成果，旨在收集、存储和解释各种生物体中基因活动的信息。它为科学家和研究人员提供了一个强大的工具，帮助他们深入了解基因在不同生理和病理条件下的表达模式和调节机制，以揭示基因功能和生物过程的奥秘。

基因表达数据库的意义和价值

基因是生物体中的遗传物质，其表达与具体生物体的特性和功能密切相关。基因表达数据库的建立和利用，可以帮助科学家们更好地理解基因调控和基因表达的机制，推动对生命活动的深入研究。通过基因表达数据库，我们可以：

• 研究基因在不同发育阶段、组织器官和细胞类型中的表达变化。
• 比较不同个体、不同物种和不同环境条件下的基因表达差异。
• 揭示基因与疾病之间的关联。
• 预测基因功能和生物过程。

常见的基因表达数据库

目前，世界范围内有许多公共和私有的基因表达数据库可供研究人员使用。其中一些数据库致力于收集特定物种或特定器官/组织的基因表达数据，而另一些则涵盖多样的物种和细胞类型。以下是一些常见的基因表达数据库：

• NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)：收录了来自各种生物体的基因表达数据，包括人类、动物、植物和微生物。
• EMBL-EBI Expression Atlas：是一个综合性的基因表达数据库，包含了多个物种和不同组织类型的数据。
• GTEx Portal：主要聚焦于人类组织样本的基因表达数据，帮助研究人员了解基因在不同组织中的表达模式。

如何使用基因表达数据库进行研究？

使用基因表达数据库进行研究需要一定的生物信息学知识和数据分析技能。一般来说，研究人员可以通过以下步骤来利用基因表达数据库进行数据挖掘和分析：

1. 选择合适的数据库，根据研究目的和数据需求。
2. 设定搜索条件并获取相关的基因表达数据。
3. 对数据进行清洗、整理和统计分析。
4. 使用合适的生物信息学工具和软件进行数据解读和可视化。
5. 结合实验验证和其他研究手段，深入探究基因调控和功能。

总结

基因表达数据库是研究基因调控和生物过程的重要工具，它为科学家们提供了大量关于基因活动的宝贵数据资源。通过使用基因表达数据库，我们能够更好地理解基因表达的模式、调控的机制以及基因与疾病之间的关联。这种深入认识将为药物研发、疾病治疗和生物学研究提供重要的帮助。

感谢您阅读本文，希望通过本文，您对基因表达数据库有了更深入的了解，并能在相关领域的研究中发挥巨大的作用。

五、mysql常用的数据库？

mysql是常用的数据库软件之一，属于免费数据库，还有db2,oracle等，现在很多中小企业用的都是mysql数据库软件，因为其免费，且性能不错，性价比高。对于大数据也具有一定的支持，单表也可以达到g级别的支持。对于程序员，mysql自然就成为首选。

六、pg数据库常用操作？

pg数据库的常用操作有以下几种：

一、查询

1）查询进程：

select * from pg_stat_activity;

说明：

datname表示数据库名

procpid表示当前的SQL对应的PID

query_start表示SQL执行开始时间

current_query表示当前执行的SQL语句

waiting表示是否正在执行，t表示正在执行，f表示已经执行完成

client_addr表示客户端IP地址

2）kill进程：

kill有两种方式，

第一种是：

SELECT pg_cancel_backend(PID);

第二种是：

SELECT pg_terminate_backend(PID);

3）查询连接数

SELECT count(*) FROM (SELECT pg_stat_get_backend_idset() AS backendid) AS s;

二、授权

1）sequence授权，跟table授权有区别

grant usage,select on sequence <sequence_name> to <role>;

三、查询size

1、sql查询

postgres=# select pg_size_pretty(pg_database_size('postgres'));

2 、linux du查询

postgres=# SELECT oid from pg_database where datname='postgres';

oid

-------

21360

查看名称为21360的文件的大小即是数据库postgres的大小;

四、解锁，注意要先连接到表所在的database

\c &dbname

select distinct a.relname,b.pid from pg_class a,pg_locks b where a.oid=b.relation and b.granted=true and a.relname like '%&table_name%';

select pg_terminate_backend(&pid);

五、查询哪些表占用的空间大。

SELECT table_schema || '.' || table_name AS table_full_name,

pg_size_pretty(pg_total_relation_size('"' || table_schema || '"."' || table_name || '"')) AS size

FROM information_schema.tables

where table_name like '%awr%'

ORDER BY

pg_total_relation_size('"' || table_schema || '"."' || table_name || '"') DESC ;

七、mpp常用数据库排名？

1、关系型数据库

数据库发展的早期，几乎都是集中式的关系型数据库的天下。

2、非关系型数据库（NoSQL）：大部分都是开源的，可谓百花齐放百家争鸣，常见的产品超过20种。

3、新式关系型数据库（NewSQL ）：NewSQL提供与NoSQL系统相同的扩展性能，且保持传统数据库支持的ACID特性。

4、MPP（Massively Parallel Processing）数据库：指使用多个SQL数据库节点搭建的数据仓库系统，MPP解决了单个SQL数据库不能存放海量数据的问题。

八、常用的数据库模型？

数据库中的数据模型一般分为层次模型、网状模型和关系模型三种。

1、层次模型

将数据组织成一对多关系的结构，用树形结构表示实体及实体间的联系。

2、网状模型

用连接指令或指针来确定数据间的网状连接关系，是具有多对多类型的数据组织方式。

3、关系模型

以记录组或数据表的形式组织数据，以便于利用各种实体与属性之间的关系进行存储和变换，不分层也无指针，是建立空间数据和属性数据之间关系的一种非常有效的数据组织方法。

九、基因克隆的几种常用方法？

基因工程的上游工程主要是目的基因的制取和无性繁殖。具体地说是从生物体的组织、器官或细胞制取目的基因或者人工合成目的基因，将目的基因与载体的DNA拼接，使重组体分子导入受体细胞，筛选和进行无性繁殖。这个过程可以称为基因克隆(gene cloning)。

十、通常用什么做标记基因？

楼上这扯淡的来。。

基因标记的选择要看具体的研究目的，理论上任何DNA片段，甚至不是基因，都可以作为标记。比如亲子鉴定的时候可以用STR，物种鉴定的时候可以用功能基因，主要是依据序列的保守性来选择。保守性低的可以用于区别群体甚至个体差异，保守性高的可以用来区别物种甚至门类。