如何使用PDB查询蛋白质结构？

一、如何使用PDB查询蛋白质结构？

打开PDB数据库输入你知道的PDB编号 如果不知道编号就输入英文名称或者简称,搜索后出现蛋白质列表 一个个看 看哪个是你想要的。点一下，右上方有下载链接。下载xxx.pdb到本地磁盘后 用pymol或者rasmol软件打开看。或者用文本编辑器打开看详细的附加信息。

二、怎么筛选PDB数据库中的蛋白？

打开PDB数据库输入你知道的PDB编号 如果不知道编号就输入英文名称或者简称,搜索后出现蛋白质列表 一个个看 看哪个是你想要的.点一下,右上方有下载链接.下载xxx.pdb到本地磁盘后 用pymol或者rasmol软件打开看.或者用文本编辑器打开看详细的附加信息.

三、请问PDB数据库文件如何打开？

　　PDB是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为.pdb。可以使用PalmReader打开。 如果想把PDB文件转换成TXT文件查看，可以使用WavePDB转。　　程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息，使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。常见的VC80.PDB（更笼统地说就是 VCx0.PDB，其中 x 表示 Visual C++ 的版本。） 该文件存储各个 OBJ 文件的所有调试信息并与项目生成文件驻留在同一个目录中。

四、如何通过sqlplus登陆PDB数据库？

开始菜单里输入cmd回车，输入sqlplus system/密码@数据库实例名 as sysdba回车，连接成功 这里的密码是创建数据库实例时指定的，数据库实例名需要在本机有配置，如果是在DB服务器上执行，实例名的问题就不用管了。

五、如何打开pdb？

在我们目前使用的掌上电脑中，Palm操作系统由于其功能强大、应用软件多等特点，占有很大的比例。PDB文件是Palm OS操作系统上数据文件类型。一般我们在使用Palm系统的电子书时都会遇到这种文件，pdb文件格式是PDA的通用格式。

如果在pc端使用，需要找特定的软件。

PDB阅读器 V1.03

六、PDB是什么？

PDB文件是Palm OS操作系统上数据文件类型。一般我们在使用Palm系统的电子书时都会遇到这种文件，一般用于电子书或手机电子书 pdb是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为.pdb。还表示碳氧同位素标准样品以及可编程延迟模块，是DSP中的一种模块，可以用来计数和延时。

七、pdb是什么单位？

PDB是protein data bank的简写，在生物学软件中，一般把蛋白质的三维结构信息用pdb文件保存。

PDB文件本质是一种ASCII码文件，可以用普通的文本编辑器编辑，也可以用专业软件编辑。不过要展示该文件所表示的蛋白质三维空间结构则需要借助相关软件，如winCoot、Moe等。

PDB(Protein Data Bank)是一种标准文件格式, 其中包含原子的坐标等信息, 提交给 Protein Data Bank at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) 的结构都使用这种标准格式. 这里整理网上已有的一些资料, 对PDB格式做个简短介绍. 对大多数用户而言, 了解这些内容就够了, 但对那些需要创建PDB文件的用户, 请参考PDB格式官方文档.

完整的PDB文件提供了非常多的信息, 包括作者, 参考文献以及结构说明, 如二硫键, 螺旋, 片层, 活性位点. 在使用PDB文件时请记住, 一些建模软件可能不支持那些错误的输入格式.

PDB格式以文本格式给出信息, 每一行信息称为一个 记录(record). 一个PDB文件通常包括很多不同类型的记录, 它们以特定的顺序排列, 用以描述结构.

八、uniprot怎么下载pdb？

在uniprot上找到pdb点击下载完成后安装即可

九、pdb是什么格式？

pdb文件本质是一种ASCII码文件，可以用普通的文本编辑器编辑，也可以用专业软件编辑。不过要展示该文件所表示的蛋白质三维空间结构则需要借助相关软件，如winCoot、Moe等。

完整的PDB文件提供了非常多的信息, 包括作者, 参考文献以及结构说明, 如二硫键, 螺旋, 片层, 活性位点. 在使用PDB文件时请记住, 一些建模软件可能不支持那些错误的输入格式.

PDB格式以文本格式给出信息, 每一行信息称为一个 记录(record). 一个PDB文件通常包括很多不同类型的记录, 它们以特定的顺序排列, 用以描述结构.

十、什么是pdb文件？

PDB文件（Program Database File）是Microsoft Visual C++编译器生成的一种二进制文件，主要包含编译器生成的源代码及符号表信息。PDB文件在程序编译链接过程中被创建，以帮助调试程序。当调试器需要加载源代码和符号信息时，它们会自动在相应目录中寻找PDB文件并加载。

PDB文件包含了编译器生成的符号信息，例如变量的名称、函数名称、行号和模块的名称等。这些符号信息有助于调试器在调试时将程序的汇编代码转换成具有可读性和可理解性的高级源代码。

PDB文件对于调试大型程序或库非常有用，因为它们允许开发人员跟踪代码执行过程中的堆栈跟踪，查看变量状态，以及定位程序崩溃或异常发生的原因。PDB文件也允许开发人员分析和优化代码性能，并查找内存泄漏和资源管理问题等。